Остроконечные кондиломы представляют собой возвышающиеся над уровнем кожи нитевидные или округлые выросты, напоминающие цветную капусту. Остроконечные кондиломы обычно встречаются в местах, которые травмируются при половом контакте. Хотя встречаются и одиночные элементы, чаще всего выявляют от 5 до 15 и больше элементов диаметром 1-10 мм.
Возможно слияние элементов в бляшки, что чаще всего наблюдают у лиц с иммуносупрессией и у больных сахарным диабетом. Цвет бородавок может быть разным: от розоватого до красного (некератинизированные бородавки), серовато-белым (при выраженной кератинизации), до коричневато-черного (гиперпигментированные бородавки). Остроконечные и папулезные кондиломы обычно не вызывают субъективных ощущений. Плоские бородавки могут иногда вызывать зуд, жжение или боль, в том случае, если появляются трещины, чаще всего в задней спайке.
Плоские кондиломы и интраэпителиальные кондиломы с эндофитным ростом обычно трудно увидеть, но при обработке уксусной кислотой место поражения приобретает белую окраску. Обычно они поражают шейку матки.