В роговом слое эпидермиса имеются чесоточные ходы, в которых можно обнаружить клещей, их яйца и экскременты. При неосложненной чесотке воспалительные явления в дерме и эпидермисе отсутствуют, за исключением тех случаев, когда самка клеща проникает в мальпигиевый слой, где из-за внутриклеточного и межклеточного отека образуется маленький пузырек.
При норвежской чесотке в рыхлом, значительно утолщенном роговом слое имеется большой количество чесоточных ходов, нередко в несколько этажей. Акантоз, воспалительные внутриклеточные пузырьки, лейкоциты и милиарные абсцессы под участками паракератотического рогового слоя. При чесотке, осложненной экзематизацией или пиодермией, гистопатологические изменения соответствуют таковым при экземе и пиодермии.