Урогенитальный кандидоз вызывается дрожжеподобными грибами рода Candida, в 90% случаев – Candida albicans. Остальные случаи могут быть вызваны преимущественно Candida glabrata, Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida krusei, Candida pseudotropicalis, Saccharomyces cerevisiae. Candida albicans обычно присутствуют во влагалище в виде бластоконидий или почкующихся форм. Гифы псевдомицелия способствуют прикреплению к ткани и внедрению в нее. Бластоконии служат для распространения Candida albicans.